食品经营许可证的办理流程如下：

1.申请：申请人需要通过当地食品药品监督管理局网站进行网上申请，并按照要求填写申请表、上传相关附件。附件必须与原件一致，包括经营者的身份证原件及复印件、营业执照原件及复印件、食品安全管理人员身份证及培训资料证明、经营场所平面布局图、周边环境图、经营者或者从业人员的健康证原件等。

2. 受理：提交申请后，食品药品监督管理局会在 5 个工作日内对提交的资料进行审核。如资料不齐全或不符合要求，会通过网上审批系统向申请人发出补正材料通知；如不属于本部门职权范围或申请事项不需行政许可的，将不予受理，并通过网上审批系统向申请人发出不予受理的理由及通知；符合申请要求的，将向申请人发出电子《受理通知书》。

3. 审查：食品药品监督管理局会对申请人提交的资料进行审查，以确保申请人符合食品经营许可证的办理条件。如审查通过，会通知申请人进行下一步操作；如审查未通过，会告知申请人原因并要求其进行整改。

4. 领证：申请人在通过审查后，需要按照食品药品监督管理局的要求，携带相关材料到指定地点进行食品经营许可证的领取。领取时需要支付相应的证书费用。

5. 公示：食品药品监督管理局会将领取食品经营许可证的企业或个人进行公示，以供公众查询。

需要注意的是，不同地区和不同食品类别的办理流程和要求可能会有所不同，申请人需要根据所在地食品药品监督管理局的具体要求进行操作。